Strategia on Åbo Akademin tärkein ohjausasiakirja.

Åbo Akademin hallituksella on kymmenen jäsentä. Hallituksen puheenjohtajana toimii Dag Wallgren.

Professori Gunilla Widén toimii Åbo Akademin vt. rehtorina.

Yliopistokollegiolla on 24 jäsentä. Puheenjohtaja on professori Elina Pirjatanniemi.

Johdon kanslia tukee Åbo Akademin johtoa päätöksenteossa.

Yliopistopalvelut tukevat Åbo Akademin ydintoimintaa opetuksessa ja tutkimuksessa.

Marianne Stenius on Åbo Akademin kansleri.